Chiudi Scheda

Informazioni Generali del Corso

Dati Generali
Tipologia del Corso:
Master di Primo Livello

Titolo:
La nuova diagnostica molecolare per la Medicina di Precisione

Titolo in Inglese:

Anno Accademico:
2017/2018
Edizione:
1
Durata:
Biennale (120 CFU)
Direttore
Nominativo:
Viglietto Giuseppe
Ruolo:
Professore Ordinario
Struttura del Docente Proponente:
Dipartimento di Medicina Sperimentale e Clinica
Sede
Sede in cui si prevede di svolgere le Attività didattiche:
Le lezioni si svolgeranno presso il Campus Universitario di Germaneto, Università Magna Grecia di Catanzaro, Italia

Obiettivi Formativi

Sede Attività Didattica:
Le lezioni si svolgeranno presso il Campus Universitario di Germaneto, Università Magna Grecia di Catanzaro, Italia
Obiettivi Formativi:
Il Master si articolerà secondo lo schema seguente: I anno: Il primo anno prevede un Modulo comune che approfondirà le basi teoriche e pratiche delle nuove tecnologie genomiche, proteomiche e di imaging applicate alla patologia e alla diagnostica molecolare. Saranno inoltre approfondite le conoscenze delle metodologie di indagine bioinformatica e statistica applicate agli studi di Next-generation sequencing e di analisi genome-wide. II anno: Il secondo anno prevede tre moduli nei quali verranno approfondite gli ambiti di applicazione delle tecnologie apprese durante il I anno: Modulo 1: Patologie oncologiche Modulo 2: Patologie cronico-degenerative Modulo 3: Medicina Forense
Finalità Professionali:
Il corso fornirà le basi teoriche e pratiche delle nuove tecnologie genomiche, proteomiche, di imaging e di bioinformatica per l'analisi dei dati, utilizzati nella diagnostica molecolare e nella medicina forense. Le tecniche affrontate dal punto di vista teorico e pratico saranno: 1) Estrazione di acidi nucleici e proteine da campioni biologici 2) PCR e RT-PCR, Q-PCR e Q-RT-PCR, Sequenziamento di Sanger, immunoistochimica; 3) sequenziamento su DNA (DNAseq) da pannelli “custom", pannelli commerciali, esomi, genomi; 4) sequenziamento su RNA (RNAseq); 5) analisi dei profili di espressione genica e di microRNA (Array); 6) Genotyping; 7) analisi bioinformatica (chiamata delle varianti nucleotidiche, identificazione di variazioni genomiche strutturali, annotazione e predizione funzionale, SNP genotyping e analisi di GWAS, analisi funzionali automatizzate di dati RNA-seq, DNA-seq, Methyl-seq; analisi di Pathway e di Network, data mining e integrazione dei dati in database pubblici come TCGA, GEO o Array Express; 8) processazione di biopsie liquide con identificazione ed enumerazione di cellule tumorali circolanti e cellule endoteliali da sangue periferico; 9) identificazione e recupero di cellule singole da fluidi biologici; 10) analisi di antigeni di membrana e intracellulari; 11) analisi funzionale di vitalità e proliferazione cellulare, del ciclo cellulare (PI, BrdU), dell’apoptosi (AnnexinV/PI o 7-AAD), del potenziale di membrana mitocondriale, della fagocitosi cellulare e del “burst” ossidativo, del Ca2+ intracellulare; 12) separazione simultanea di popolazioni cellulari (fino a 4); 13) allestimento campioni citologici (aspirativa ed esfoliativa), allestimento citoinclusi, immunocitochimica; 14) allestimento campioni istologici (inclusione, taglio, colorazione, immunostochimica, ibridazione in situ, FISH) e di Tissue-Arrays (TMA); 15) Laser capture microscopy; 16) valutazioni anatomo-patologiche per diagnostica citologica ed istologica su tessuto umano e/o animale anche in patologia digitale; 17) identificazione, caratterizzazione ed analisi di proteine; 18) determinazione di modificazioni proteiche post-traduzionali; determinazione del peso molecolare di peptidi sintetici e proteine ricombinanti; 19) Metodologie di indagine biostatistica applicate agli studi di Next-generation sequencing e di analisi genome-wide di SNP (GWAS). 20) Test di paternità 21) Estrazione del DNA da qualsiasi tipo di traccia o campione biologico effettuata con metodiche automatizzate di ultima generazione 22) Analisi del profilo genetico attraverso l’analisi di tutti i marcatori validati per l’uso forense e accettati dalle comunità scientifiche nazionali ed internazionali (GeFI, SIGU, ISFG, SWAGDAM) 23) Analisi dell’aplotipo del cromosoma Y genetico attraverso l’analisi di tutti i marcatori validati per l’uso forense e accettati dalle comunità scientifiche nazionali ed internazionali (GeFI, SIGU, ISFG, SWAGDAM). 24) Analisi del profilo del cromosoma X attraverso l’analisi di tutti i marcatori validati per l’uso forense e accettati dalle comunità scientifiche nazionali ed internazionali (GeFI, SIGU, ISFG, SWAGDAM) 25) Analisi dell’aplotipo del DNA mitocondriale tramite metodologie di sequenziamento diretto del DNA Nel Secondo anno saranno approfondite le basi molecolari di alcune fra le patologie cronico-degenerative più diffuse quali diabete e squilibri del metabolismo, cardiomiopatie, demenze, malattia di Alzheimer, morbo di Parkinson e cancro. In particolare saranno definite le basi fisiopatologiche e biochimico-molecolari dei processi neoplastici, dismetabolici, ormonali e degenerativi in cui il ricorso alle tecniche di analisi genomica e proteomica può migliorare l'inquadramento diagnostico e la definizione della terapia in relazione alle indicazioni linee guida internazionali. Saranno anche affrontate le tematiche relative all'identificazione e allo studio dei biomarcatori nelle diverse patologie e il loro eventuale ruolo nella definizione delle strategie terapeutiche.
Sbocchi Professionali:
La formazione specialistica, derivante dal conseguimento del Master, potrà accelerare e rendere più favorevole l’inserimento dei laureati nel mondo del lavoro, in considerazione della crescente diffusione delle tecniche di genetica molecolare in ambito diagnostico. La figura professionale formata nel Master può trovare sbocco in: • Centri di diagnostica pubblici e privati • Centri di Ricerca pubblici e/o privati, I.R.C.C.S , C.N.R. e Laboratori Universitari • Industrie Farmaceutiche • Aziende biotecnologiche • Istituti Zooprofilattici • Clinical Research Organization, Osservatori Epidemiologici, • Aziende che si occupano di consulenza di statistica genetica e genomica • Consulenti e periti nei processi penali e civili.
Rapporti con il mondo produttivo:
Risorse del Personale Tecnico e Tutor:
La dotazione strumentale della piattaforma di genomica funzionale e patologia molecolare ove si effettuerà il Master consiste di due piattaforme di sequenziamento: i) Illumina e Life Technologies supportate entrambe da una piattaforma di BioInformatica applicata alla Bio-Medicina. La piattaforma Illumina comprende: i sequenziatori HiSeq2500 e MiSeq e il lettore di array HiScan. La piattaforma Life Technologies comprende: i sequenziatore PGM-Personal Genome Machine, PGMdx-Personal Genome Machine e ION Proton nonchè attrezzature di supporto (IonChef, VerityDx) e software di analisi (Ion Reporter™ Software). La Piattaforma di genomica comprende anche una strumentazione accessoria e necessaria al sequenziamento: Tape Station 2200, Qubit Fluorimeter, termociclatori (QuantStudio 12K Flex, Biorad C1000 System) e spettrofotometri (MultiScan GO). La sezione di patologia molecolare è dotata di citofluorimetri analitici e preparativi (BD LSRFortessa™ X20 con 3 laser e 14 fluorescenze; BD Accuri™ con 2 laser e 4 fluorescenze; BD FACSAria™ III con 3 laser, 8 fluorescenze e 4 vie di sorting); il sistema Cellsearch System per identificare ed enumerare cellule rare da fluidi biologici; il sistema DepArray per identificare, quantificare e recuperare singole cellule. La piattaforma di patologia molecolare è inoltre equipaggiata con attrezzature dedicate al campionamento dei reperti macroscopici e microscopici, all'esecuzione automatizzata delle tecniche istologiche di routine e di un sistema di patologia digitale. Le attrezzature tecnologiche della piattaforma comprendono: sistema integrato di processazione tissutale; sistema automatizzato di ibridazione e colorazione per immunoistochimica e FISH; scanner per patologia digitale; microdissettore laser; carotatore per assemblaggio Tissue Micro Array (TMA). Il cluster di calcolo ad alte prestazioni associato alle piattaforme comprende 4 server High Performance Computing, 8 processori, 16 Threads con memoria RAM tolale di 768 GB, 3 Server di supporto con 2 processori e 12 Threads, con memoria RAM totale di 192 GB e una capacità di storage complessiva di 192TB. La piattaforma di proteomica è dotata di due potenti strumenti per l’analisi di miscele complesse di proteine/peptidi quali lo Spettrometro di massa Q Exactive ibrido quadrupolo completo di sorgente AP-MALDI (Atmospheric Pressure-Matrix Assisted-Laser-Desorption-Ionization) e lo Spettrometro di massa Q Exactive ibrido quadrupolo accoppiato a sistema di nanocromatografia liquida ad alta pressione (nanoLC).
Organizzazione del Corso:
Il corso prevede sia per le lezioni frontali sia per le attività teorico-pratiche di laboratorio 10 ore di frequenza a settimana. E’ obbligatoria la frequenza sia per le lezioni frontali (almeno il 70%) sia per le attività teorico-pratiche di laboratorio (almeno il 70%).

Piano Didattico

Insegnamento: Basi teoriche e pratiche delle nuove tecnologie genomiche
CFU: 7
SSD: MED/04 PATOLOGIA GENERALE
Insegnamento: Basi teoriche e pratiche delle nuove tecnologie proteomiche
CFU: 7
SSD: BIO/11 BIOLOGIA MOLECOLARE
Insegnamento: Basi teoriche e pratiche delle nuove tecnologie applicate alla patologia e alla diagnostica molecolare.
CFU: 5
SSD: MED/04 PATOLOGIA GENERALE
Insegnamento: Basi teoriche e pratiche delle nuove tecnologie di imaging applicate alla patologia e alla diagnostica molecolare.
CFU: 5
SSD: MED/04 PATOLOGIA GENERALE
Insegnamento: Metodologie di indagine bioinformatica e statistica applicate agli studi di Next-generation sequencing
CFU: 7
SSD: ING-INF/05 SISTEMI DI ELABORAZIONE DELLE INFORMAZIONI
Insegnamento: Metodologie di indagine bioinformatica e statistica applicate agli studi di analisi genome-wide.
CFU: 7
SSD: ING-INF/05 SISTEMI DI ELABORAZIONE DELLE INFORMAZIONI
Insegnamento: Medicina di precisione applicata alle Patologie oncologiche
CFU: 7
SSD: MED/04 PATOLOGIA GENERALE
Insegnamento: Medicina di precisione applicata alle Patologie cronico-degenerative Primo modulo
CFU: 6
SSD: MED/26 NEUROLOGIA
Insegnamento: Medicina di precisione applicata alla Medicina Forense: amplificazione e tipizzazione del DNA avanzata, nuove strategie tecnologiche di analisi
CFU: 7
SSD: MED/43 MEDICINA LEGALE
Insegnamento: Le nuove frontiere della Medicina Forense Molecolare
CFU: 7
SSD: MED/43 MEDICINA LEGALE
Insegnamento: Principi generali delle scienze genetiche forensi
CFU: 7
SSD: MED/43 MEDICINA LEGALE
Insegnamento: Genetica Medica
CFU: 7
SSD: MED/03 GENETICA MEDICA
Insegnamento: Biochimica Clinica: identificazione di nuovi marcatori
CFU: 6
SSD: BIO/10 BIOCHIMICA
Insegnamento: Linee guida internazionali per le analisi genetico – forensi e certificazione di qualità nei laboratori forensi
CFU: 6
SSD: MED/43 MEDICINA LEGALE
Insegnamento: Oncologia Molecolare
CFU: 7
SSD: MED/04 PATOLOGIA GENERALE
Insegnamento: Nuove frontiere delle Genetica applicata alle Scienze Cliniche
CFU: 6
SSD: MED/04 PATOLOGIA GENERALE
Insegnamento: Medicina di precisione applicata alle Patologie cronico-degenerative secondo moduo
CFU: 6
SSD: MED/11 MALATTIE DELL'APPARATO CARDIOVASCOLARE

Prova Finale


10
  • Tesi
Discussione di una tesi su un tema scelto dal candidato

Requisiti di Ammissione e Numero Iscritti

Requisti di Ammissione
Classi di Laurea:
  • L-02 - Biotecnologie
  • L-29 - Scienze e tecnologie farmaceutiche
  • L/SNT3 - Scienze delle professioni sanitarie tecniche
  • LM-06 - Biologia
  • LM-09 - Biotecnologie mediche, veterinarie e farmaceutiche
  • LM-13 - Farmacia e farmacia industriale
  • LM-41 - Medicina e chirurgia
  • LM-54 - Scienze chimiche
Altri Titoli di Accesso:
Numero Iscritti e Costi Iscrizione
Numero Minimo Iscritti:
5
Numero Massimo Iscritti:
15
Costo Iscrizione:
2500€

Comitato di Coordinamento

Nome: Giuseppe Viglietto
DOCENTE UMG
Ruolo : Professore Ordinario
Nome: Malanga Donatella
DOCENTE UMG
Ruolo : Ricercatore
Nome: Costanzo Francesco Saverio
DOCENTE UMG
Ruolo : Professore Ordinario
Nome: Cuda Giovanni
DOCENTE UMG
Ruolo : Professore Ordinario
Chiudi Scheda